新生儿病理性黄疸原因是非常复杂的，常见第一是黄疸生成过多；第二是肝细胞异常；第三是排泄的异常。具体如下：
1、引起黄疸生成过多的原因包括：感染，如果新生儿有早期感染，他就会引起黄疸生成过多；红细胞增多症，如果红细胞增多，红细胞破坏的就比较多，进而引起黄疸会就是产生的比较多；产生溶血性黄疸，就是母子血型不合，ABO血型不合或者Rh血型不合，也会引起黄疸，红细胞破坏的多也是引起黄疸生成过多；还有就是母乳性黄疸，母乳含有一种酶叫UDPGT酶，这个酶也会就是说引起胆红素生成过多，进而引起病理性黄疸；
2、肝功能异常，比如有巨细胞病毒的感染、乙肝病毒感染，这些会引起肝功能异常，也会引起胆红素的代谢异常，进而引起黄疸代谢异常，黄疸会出现病理性黄疸；
3、排泄异常，比如有胆道闭锁或者胆汁淤积、或者胆总管囊肿，这些也会引起黄疸排泄少，这样体内会黄疸蓄积过多，出现病理性黄疸。
4、其他还有非常多的原因，比如遗传代谢病、比如电解质紊乱、巨大儿、母亲有异常病史，这些也会引起黄疸。