手足口病大多数情况可以自愈，无需特殊处理，主要是对症处理。但需要分清楚普通病例和危重病例，因为它们的预后是不同的，治疗也不同。具体如下：
1、普通的病例无需住院，注意隔离，避免交叉感染。适当休息，清淡饮食，做好口腔和皮肤的护理；也可以对症治疗，发热可以采用中西医结合治疗，药物可选用四季抗病毒合剂、小儿化毒散、复方锌布颗粒、复方维生素制剂等；
2、重症的病例需要住院治疗。手足口病患儿如导致神经系统受累，首先要控制颅内高压，限制入量，可以用甘露醇、速尿。根据患儿病情可以调整剂量，必要时可以用免疫球蛋白治疗，总量可以2g/kg，分2-5天给予，酌情可以使用糖皮质激素。如果导致呼吸循环衰竭，紧急的情况下要给予吸氧，保持呼吸道通畅，必要的时候呼吸机辅助通气，确保两条静脉通路，监测呼吸、心率、血压、血氧饱和度。保护重要脏器的功能，维持内环境的稳定。监测血糖的变化，严重的高血糖可以应用胰岛素治疗，同时头、肩抬高15°-30°，保持中立体位，保留胃管及导尿管。