卵圆孔未闭手术后遗症发生率比较少，具体如下：
1、溶血：如果做外科手术，并发症发生率较低。送入的封堵器外面是金属网，中间是促凝物质，软而有弹性。通过疏通器在压缩的前提下输送到房间隔位置，当管道撤除后，封堵器弹开，形成原来的塑形模样，如同哑铃或伞状，从房间隔两侧夹住房间隔，使卵圆孔闭合。因为中间是金属网，加促凝物质，刚做完手术后，近期血液还未完全凝固，手术后早期容易产生左向右分流。如果左向右分流持续存在，血液中血细胞从左侧进入右侧，通过血管网时易产生溶血；
2、未完全闭合，即大孔变成较小的缝隙。部分患者卵圆孔持续不关闭，还有气泡进入，可引起偏头疼，反复头疼经治疗用阿司匹林后，多数可缓解。