小儿脑肿瘤的手术费用与肿瘤的类型、位置、大小、病程等相关，手术费用一般不菲。普通的胶质瘤可能花费40000-60000元左右，比较复杂的肿瘤，甚至合并其它疾病等，手术可能需要分期进行，费用就比较高，需要70000-80000元，甚至更高,，而且依据患者体质、治疗方法、医院等级的不同，费用也会有比较大的差异。
它主要包括手术费、床位费、治疗费、手术前的检查以及手术后的检查、手术的麻醉费、术后的药物等等，故每个患者的手术费用存在较大的差异。有的病人肿瘤比较复杂，对病人来说影响比较大，术后需要去重症监护室，这种病人的费用就会多一些；部分病人做完以后完全清醒，拆线出院非常顺利，这一部分病人费用相对低一些。
复杂部位的肿瘤若为脑深部肿瘤，与周围组织关系密切，手术时间长，损伤范围大，可能需要数万元甚至数十万元的手术费用，围手术期恢复缓慢，医疗费用可能更大。对于住院时间长、在重症监护室待的时间长的病人，这部分费用可能会更高。