小儿脑肿瘤切除后可能合并后遗症，主要是由瘤体或者手术所造成的神经功能受损所致。在手术切除肿瘤的过程中，往往由于肿瘤组织与脑组织的粘连或手术切除的需要而造成一些脑神经组织的受损，从而产生一些相应的临床症状，比如出现肢体麻木、疼痛、运动不灵、语言不利等等症状。不能完全切除的肿瘤，其残余的肿瘤瘤体的存在将继续产生对局部脑组织的压迫，而表现出各种不适症状，如头痛、头晕、恶心、呕吐等，这些都是脑瘤术后后遗症的表现，需要通过后期的康复治疗来解决脑瘤的后遗症。
根据脑肿瘤的性质和发生部位的不同，决定了手术后后遗症会有不同的表现。恶性肿瘤病情进展比较快，术后复发率高。良性肿瘤术后预后较好，后颅窝肿瘤手术后容易出现颅内压症状、脑积水、颅内感染、脑脊液漏、头晕、共济失调、行走不稳、尿失禁、痉挛性脑瘫、呼吸循环衰竭；幕上肿瘤术后容易出现精神障碍、癫痫、偏瘫、失语、昏迷、植物状态；颅底肿瘤术后容易出现视力下降、视野缺损、复视、尿崩、水电解质紊乱、嗜睡、发育障碍以及消化道出血等。