早产儿若出现肠道感染需及时到医院就诊，通过医生病史采集、体格检查、粪便、血液等检验明确是细菌性感染还是病毒性感染，或因消化不良引起，以及判断是否伴有脱水、电解质紊乱情况，从而给予相应抗感染治疗及补液等支持治疗。
另外新生儿坏死性小肠结肠炎简称NEC，属于早产儿常见的严重胃肠道感染性疾病。NEC发生与胎龄相关，胎龄越小发病时间越晚，临床表现为腹胀、呕吐、血便。通常早期可能仅出现喂养不耐受，腹部X检查以肠壁囊样积气为特征。NEC死亡率和后遗症发生率较高，所以需到专业医院住院治疗，需要给予禁饮食、持续胃肠道减压、抗感染治疗、支持疗法等。若合并肠穿孔等外科情况需手术治疗。
所以新生儿应母乳喂养，母乳喂养是预防新生儿尤其是早产儿肠道感染最佳方法。