小儿病毒性心肌炎，多数孩子预后良好，大部分孩子经过正规的治疗和合理的休息以后，多数半年、数月至数年以后都会逐渐的达到痊愈。具体如下：
1、如果是严重的心肌炎，甚至是暴发性心肌炎，病情会在数小时甚至数天内恶化，如果治疗不及时，会出现心源性休克、抽搐、晕厥，死亡率较高；
2、大部分孩子在治疗以后，极少数孩子会留下心脏的后遗症，慢性期时会出现左心室收缩功能下降、慢性心功能不全、心脏进行性扩大，即扩张性心肌病，这种孩子的预后都会很差；反反复复出现胸闷、憋气、乏力，数年以后就会出现扩张性心肌病，最后需要做心脏移植治疗；
3、预后的好坏与感染病毒的类型有关，如果病毒的毒性较大，不容易好转，会持续很长时间；如果病毒的毒性较小，就会好治些；
4、年龄越小，比如新生儿发病，治疗起来就比较困难，预后不好、死亡率也较高。