生殖器念珠菌可引起念珠菌性外阴阴道炎、包皮龟头炎等疾病，虽然并不属于性病的范畴，但是很多人并分不清生殖器疾病与性病，将其视为性病，患者也会因此产生巨大的心理压力。
念珠菌属于人体的正常菌群，分布于皮肤及口腔、阴道粘膜上，正常情况下并不会致病，约有10%的健康妇女和30%的孕妇可无任何临床症状而阴道有念珠菌生长；一些包皮偏长、局部温暖湿润，又不注意个人卫生的男性，也常会导致念珠菌生长。当机体抵抗力下降（如妊娠、糖尿病、长期应用抗生素或雌激素、类固醇皮质激素）或阴道局部环境改变时（如PH值升高、乳酸杆菌减少），念珠菌就会大量繁殖，产生病变。
女性阴道内生长着大量的乳酸杆菌，以维持偏酸性（PH值约为4.5）的微环境，抵抗各种致病微生物的侵袭，有利于人体的健康。在性活后，PH值为7.0以上的男性精液可中和偏酸性的阴道微环境，女性性生活过频者，易发生阴道念珠菌病；如存在有念珠菌感染时，夫妻性生活后会加重外阴阴道部位瘙痒和灼热感，男性阴茎包皮及龟头轻度潮红，包皮内侧或冠状沟白色奶酪样斑片，偶可有瘙痒感。
过度清洗是诱发和加重外生殖器念珠菌感染的重要外在因素。生活条件改善，注意卫生保健，其本身是一种有利于健康的卫生行为。当发生外阴阴道不适感觉后，适当用清洗剂坐浴和冲洗阴道，是一种辅助治疗的方法，但应适可而止。若过度清洗，则会加重局部微环境失衡，对机体健康则有弊无益。加上一些清洗剂本身的刺激作用，阴道及外阴部皮肤保护层被破坏，则不仅加重炎症症状，而且由于局部组织结构的破坏，更有利于念珠菌的侵袭而致病。
